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Comment obtenir des biomolécules de grande qualité ? Quels seront les futurs outils pour l'analyse du génome et de son expression au niveau cellulaire ?

C'est à ces questions que tenteront de répondre des experts mondiaux réunis à l'occasion de cet évènement

Aujourd’hui, un des plus grands challenges pour des biologistes est de pouvoir comprendre et analyser l’expression du génome dans une cellule type dans son environnement tissulaire, ce qui veut dire pouvoir isoler ces cellules et travailler sur de très petites quantités de matériel biologique.

L’objectif de ce symposium est de rassembler des experts mondiaux et de proposer un regard sur les connaissances d’aujourd’hui qui nous permettent d’obtenir des molécules de grande qualité. Au-delà, il s'agira d’explorer les développements futurs en outils "omics" (ADN, ARN et protéines) pour l’analyse du génome et de son expression au niveau cellulaire.

Ce symposium est le deuxième (après l'International Symposium on Microgenomics de 2014) de ce type en France et en Europe.

Il sera organisé autour de 3 sessions :

• Techniques d’échantillonnage  (cytométrie de flux, microdissection laser, et autres nouvelles methods d’isolation des cellules et exosomes)
• Acides nucléiques et microgénomique
• Protéines et microgénomique

Workshop technique de microgénomique

Workshop technique de microgénomique INRA Jouy-en-Josas 31 Mai et 1er Juin 2016

Introduction

• Michael Tangrea (Lapidus Cancer Institute, USA) : La microdissection laser : principes et applications
• Andréa Rau (GABI, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, France) : La conception expérimentale et l’analyse statistique en génomique
• Lance Liotta (George Mason University, USA) : Les interactions protéine-protéine : la cartographie des régions de contacts entre les protéines, les futures cibles de médicaments dans l’avenir

Workshops : ateliers techniques

• La qPCR - Michael Kubista (TATAA Biocenter, Sweden) :

       - Comment analyser vos données de qPCR, des concepts de base à l’analyse de l’expression et le contrôle qualité
       - Atelier technique : la PCR quantitative sur la plateforme @BRIDGe : qPCR haut débit à partir de quelques cellules

• La Microdissection - Plateforme @BRIDGe, INRA :

       - Le workflow pour des projets de microdissection : étapes critiques pour obtenir des résultats fiables (présentation théorique)

       - Atelier technique : cryosection, préparation des lames, microdissection et contrôle qualité des biomolécules extraites

•  NGS - Plateforme ENS : principes et applications

       - Le contrôle qualité des échantillons
       - La préparation des banques à partir de petites quantités de matériel biologique et une comparaison des kits
       - Contrôle Qualité des données produites
       - La normalisation des banques

•  La protéomique - Céline Henry et Sophie Liuu (MICALIS, Plateforme PAPPSO, INRA, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, France)

         - Identification et quantification des protéines au moyen d’un spectromètre de masse à haute résolution
         - Introduction à la spectrométrie de masse, préparation des échantillons (étapes critiques) et traitement des données

Visite des plateformes INRA

(Pour les doctorants rattachés à l'école doctorale ABIES , le Workshop et le Congrès sont reconnus en modules de formation. Le certificat de participation sera remis sur demande)