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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Les vidéos et présentations de la formation "génomique environnementale" sont disponibles.

Formation à la génomique environnementale : vidéos et présentations
Cette session a été organisée du 23 au 27 mai 2016 (AgroParisTech, rue Claude Bernard, Paris) pour les doctorants des ED ABIES et GAIA, ainsi qu'aux chercheurs et ingénieurs intéressés par la thématique de la génomique environnementale.

Thèmes

  • Genetic structuring of a set of individuals and/or populations genotyped with molecular markers;
  • Interpretation of the  genetic structuring by environmental variables;
  • Detection of genomic footprints of selection related or not with environmental variables;
  • Functional characterization of candidate genes.

Vidéos et présentations

General introduction on animal adaptation. Tatiana Zerjal (INRA/AgroParisTech-GABI, Jouy-en-Josas/Paris)

Models of population genetics and measures of the neutral diversity. A reminder.Renaud Vitalis (INRA-CBGP, Montpellier)

Selection footprints. General introduction. Renaud Vitalis (INRA-CBGP, Montpellier)

Selection footprints. 1 - PCADAPT.Keurcien Luu (TIMC-IMAG, Grenoble)

Selection footprints. 2 - SelEstim.Renaud Vitalis (INRA-CBGP, Montpellier)

The HapFLK method.Simon Boitard (INRA-GenPhyse, Toulouse)

Multivariate Data Analysis: an introduction with a focus on Principal Component Analysis on SNP data.Denis Laloë, Tatiana Zerjal, Xavier Rognon (INRA/AgroParisTech-GABI, Jouy-en-Josas/Paris)

Multivariate Data Analysis: Geometrical aspects - the inertia.Denis Laloë, Tatiana Zerjal, Xavier Rognon (INRA/AgroParisTech-GABI, Jouy-en-Josas/Paris)

Links with environmental covariables. Factorial methods. (PCAIV, Redudancy analysis).Denis Laloë (INRA/AgroParisTech-GABI, Jouy-en-Josas/Paris)

Links with environmental covariables. BayPass.Mathieu Gautier (INRA-CBGP, Montpellier)

Links with environmental covariables. Factor analysis. (LFMM/LEA).Olivier François (TIMC-IMAG, Grenoble) [Speaker: Denis Laloë]

Functional anlaysis. Biological interpretation of selection footprints. Laurence Flori (INRA-GABI, Jouy-en-Josa / CIRAD-INTERTRYP, Montpellier)
 

Voir aussi