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Comme les projets ENCODE chez l’homme et plusieurs espèces modèles, FAANG est focalisé sur l’étude du transcriptome (par RNAseq et Small RNAseq) et de l’architecture et dynamique de la chromatine (par méthodes similaires à DNase-seq, et ChIp-seq  des marques d’histones). Des approches  complémentaires comprennent  la cartographie de contacts (chromosome conformation capture 3C, Hi-C) et le profilage de la méthylation de l’ADN.

Plus de 130 scientifiques sont membres du projet FAANG dont 14 chercheurs de l’INRA et 5 scientifiques de l’unité GABI.

Plusieurs  projets pilotes sont en cours. En Europe, un des projets est coordonné au sein de GABI et en collaboration avec les Pays Bas et le Royaume Uni (FR-AGEncode), avec le soutien financier du Métaprogramme SelGen de l’INRA. Aux Etats Unis, les  partenaires sont l’USDA avec le projet Génome NRSP-8 (bovin, volailles et porc) et le National Pork Board avec un projet coordonné par l’Université de Californie – Davis sur la génomique fonctionnelle chez le porc et des contributions sur les bovins et les volailles.

Le lancement officiel du projet FAANG a eu lieu en janvier 2015 pendant le congrès PAG à San Diego;