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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Vers une amélioration de la résistance à la paratuberculose bovine en race Holstein grâce à une évaluation génomique Single-Step

INRAE
La paratuberculose bovine est une maladie contagieuse, incurable et difficile à contrôler, causée par Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Elle a des effets néfastes sur le bien-être des animaux et des conséquences économiques importantes. Des premiers travaux, réalisés sur plus de 1600 vaches Holstein et 900 vaches Normande avec des statuts confirmés et des génotypes (projets PICSAR/PARADIGM), ont mis en évidence des régions du génome impliquées dans la résistance à cette maladie. Ces résultats ont encouragé une remontée massive des dosages sérologiques (ELISA), réalisés sur du sang de vaches issues d’élevages du grand Ouest engagés dans un plan de lutte contre MAP.

Pour mieux comprendre le déterminisme génétique de la résistance à la paratuberculose et évaluer l’intérêt de mettre en place une sélection génomique pour ce caractère, une approche dite Single-Step SNP BLUP a été appliquée à un pedigree de 161 253 animaux Holstein parmi lesquels 56 766 vaches avaient un statut pour la paratuberculose et 12 431 vaches et taureaux étaient génotypés avec une puce de moyenne densité. L’héritabilité du caractère est modérée (h²=0,14) et 16 régions du génome, affectant la résistance à la paratuberculose sont identifiées. L’évolution génétique de la résistance à la maladie est légèrement favorable au cours des deux dernières décennies. Testée dans une population de validation de 907 vaches, les prédictions génomiques s’avèrent précises, avec un coefficient de détermination R² de 0,55. Ces prédictions permettent d'identifier les vaches sensibles, à haut risque d'infection, ainsi que les taureaux résistants, à utiliser préférentiellement dans les élevages atteints. Cette étude apporte de nouvelles connaissances sur le déterminisme génétique de la résistance à la paratuberculose et montre que ce caractère peut être prédit à partir des phénotypes de prophylaxie et des génotypes produits en routine pour la sélection génomique. Elle a débouché sur la mise en place d'une évaluation génomique Single-Step qui devrait rapidement devenir un outil efficace pour le contrôle de la paratuberculose dans les élevages Holstein. L’extension à la race Normande est en cours.

Contact scientifique

Référence

Sanchez M.-P., Tribout T., Fritz S., Guatteo R., Fourichon C., Schibler L., Delafosse A., Boichard D. New insights into genetic resistance to paratuberculosis in Holstein via a single-step genomic evaluation. 2022. Genet. Sel. Evol. 54:67. https://doi.org/10.1186/s12711-022-00757-z

Voir aussi

Cette étude a été réalisée dans le cadre des projets PARADIGM (APIS-GENE et GDS France) et PICSAR (INRAE, GISA), dont les premiers résultats génétiques ont été publiés en 2020 : Sanchez M.-P., Guatteo R., Davergne A., Grohs C., Taussat S., Fritz S., Boussaha M., Blanquefort P., Delafosse A., Joly A., Schibler L., Fourichon C., Boichard D. 2020. Identification of the ABCC4, IER3, and CBFA2T2 candidate genes for resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein and Normande dairy cattle. Genet. Sel. Evol. 52:14. https://doi.org/10.1186/s12711-020-00535-9