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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Des liens entre la composition du microbiote fécal et la réponse à la vaccination contre la grippe chez le porc

@INRAE Marion Borey, Claire Rogel-Gaillard (légende: Summary of taxonomic annotation and quantitative analysis of the 23 OTUs that were differentially abundant in the D28 fecal microbiota of pigs that demonstrated extreme IAV-specific IgG responses at D63. OTUs are ordered according to their phylogeny. Taxonomic classification is indicated at the genus level except for two OTUs annotated at the levels of family (f) and order (o). The cluster identifier for each OTU is indicated in parentheses after the taxonomic annotation. The Log2 fold change (Log2 FC) between high (red) and low (blue) responders is represented by horizontal histograms together with the mean relative abundance, in percentage (%), per group. The respective occurrence of each OTU in high (red) and low (blue) responder groups is indicated on the right hand of the figure and indicates the percentage of individuals per group that contained that OTU.)
Une étude conduite par l’équipe Génétique, Microbiote, Santé de l’unité GABI met en évidence qu’il existe, chez le porc, des liens entre la composition du microbiote intestinal et la réponse immunitaire à un vaccin dirigé contre le virus de la grippe porcine (influenza A virus, IAV)). Le microbiote intestinal avant vaccination diffère entre forts et faibles répondeurs à la vaccination et contient des informations prédictives de ces niveaux de réponse. Une abondance plus élevée en certains genres bactériens est trouvée associée à une meilleure réponse immunitaire au vaccin.

Il existe une variabilité individuelle des réponses vaccinales qui peut affaiblir la protection à l’échelle d’un troupeau. En identifier les causes et les prédire définissent des pistes de recherche pour améliorer la santé et le bien-être en élevage.

Le microbiote intestinal interagissant avec le système immunitaire de son hôte, notre étude a eu comme objectif d’analyser les liens avec l’intensité de la réponse vaccinale chez des porcs vaccinés contre l’IAV. Les animaux ont été vaccinés le jour du sevrage à 28 jours d’âge (J28), avec un rappel trois semaines plus tard. Leurs réponses immunitaires à la vaccination ont été suivies par des dosages d’anticorps spécifiques et des tests d’hemagglutination à différents temps : précocement (le jour du rappel), au pic de réponse (1 et 2 semaines après le rappel) et avant abattage entre 140 et 150 jours d’âge (persistance d’anticorps sur le long terme). Le microbiote a été caractérisé par séquençage du gène de l’ARNr 16S de l’ADN fécal et analyse des unités taxonomiques (OTU pour Operational Taxonomic Unit).

Nous avons observé une richesse microbienne du microbiote fécal avant vaccination plus élevée chez les forts répondeurs au vaccin en comparaison des faibles répondeurs, avec une surabondance en OTU annotées au genre Prevotella et à la famille des Muribaculaceae. A contrario, les plus faibles répondeurs présentaient une plus forte abondance en OTU des genres Helicobacter, Bacteroides,Christensenellaceae R7-group, Succinivibrio, et Escherichia-Shigella. Ces genres bactériens suggèrent que les associations identifiées impliquent des mécanismes liés à la synthèse d’acides gras libres favorisant la stimulation du système immunitaire ou à des LPS ayant des propriétés immunomodulatrices variées. Nous avons également identifié à J28 un groupe de 81 OTU prédictrices de l’intensité du pic de réponse.

Ces résultats prometteurs nécessitent des études complémentaires avant d’envisager leur exploitation dans des protocoles de vaccination.

Référence:
Borey M, Blanc F, Lemonnier G, Leplat J-J, Jardet D, Rossignol M-N, Ravon L, Billon Y, Bernard M, Estellé J, Rogel-Gaillard C. Links between fecal microbiota and the response to vaccination against influenza A virus in pigs. npj Vaccines 6, 92 (2021). https://doi.org/10.1038/s41541-021-00351-2

Contact :

  • Marion Borey (marion.borey(at)inrae.fr)
  • Claire Rogel-Gaillard (claire.rogel-gaillard(at)inrae.fr)

Voir aussi

Financements :

Projet européen H2020 SAPHIR « Strengthening Animal Production and Health through the Immune Response » (http://www.h2020-saphir.eu/) ; Mécénat Crédit Agricole Ile de France (programme jeunes talents)

Plateformes et installations expérimentales :