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Thématique globale 

Allier génétique et physiologie pour obtenir des poissons robustes et efficients dans des environnements variés et fluctuants. Depuis 2016, nous travaillons également sur l’abeille.

Résultats marquants

• Estimation des valeurs économiques et environnementales des caractères sélectionnés
• Architecture génétique des caractères clés pour une aquaculture durable : production de connaissance et transfert à la profession
• Coordination du projet Infrastructures Européen AQUAEXCEL2020

Questions scientifiques

1- Architecture génétique des caractères d’efficience

Nous nous focalisons sur les caractères d’efficience qui amélioreront le pilier économique du développement durable mais aussi les piliers environnementaux et sociaux.
- Efficacité alimentaire
  Projets associés : H2020 Embric, PerformFish, AquaImpact.
- Résistance aux maladies : bases génétiques et fonctionnelles de la résistance aux maladies virales et bactériennes.
  Projets associés : H2020 Aqua-Faang ; FEAMP SG-Truite et Gènesea.
- Profil d’acides gras du muscle
  Projet associé : FEAMP OmegaTruite
- Allocation des ressources : interactions entre caractères d’efficience et avec les caractères fonctionnels (santé, immunité, réponse au stress, comportement, reproduction …). Thème en développement.

2- Physiologie et génétique de la réponse à des stress environnementaux ou d’élevage

Nous combinons des approches physiologiques, comportementales, génétiques et épigénétiques pour étudier les réponses à différents stress.
- Adaptation aux nouveaux aliments, notamment les aliments végétaux : (projets associés : FUI Ninaqua, FEAMP AntiOb
- Adaptation à la température, sensibilité à l’environnement et épigénétique, variabilité génétique des marques épigénétiques. (projets associés : H2020 AQUAEXCEL2020, FEAMP Epicool).
- Conséquences à long terme d’événements précoces : conséquences, y compris transgénérationnelles, de l’exposition à des stress thermiques ou à des polluants. (projets associés : Sushifish, Ephemare, PlasticSeine).
- Déterminisme génétique et environnemental du sexe: génétique de la masculinisation spontanée (truite). Identification des néomâles avec les prédictions génomiques ; lien phénotype sexuel - modification d’expression de gènes candidats ou de marques épigénétiques (bar). (projets associés : FEAMP Neobio, 3S, ERANet Sushifish, H2020 AQUAEXCEL2020)

3 – Gestion des populations sélectionnées

- Sélection génomique: intérêt et optimisation de la sélection génomique pour différents caractères et différentes espèces (truite, bar et daurade). (projets associés : FEAMP SG-Truite et GèneSea, deux thèses CIFRE)
- Modélisation des schémas de sélection chez l’abeille : mise en oeuvre de programmes de sélection efficaces pour améliorer la production (gelée royale ou miel), le comportement des abeilles et leur santé. (projet associé : Beestrong)
- Nouvelles technologies de reproduction : transplantation de cellules souches et cryoconservation. (projet associé : FEAMP Biogerm).

Nous continuons aussi à développer des ressources génomiques.

Dispositifs de recherche

• Piscicultures expérimentales : INRAE : PEIMA (Sizun) et IERP (Jouy en Josas), Ifremer Palavas
• Ressources génétiques originales développées par l’équipe
• Cellule Bioinformatique GABI, Sigenae et plateformes de génomique : GeT-Plage, @BRIDGe, Gentyane.

Collaborations et partenaires

• Professionnels de la sélection piscicole et apicole : SYSAAF (Syndicat des sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), ITSAP- Institut de l’Abeille, sélectionneurs
• Collègues INRAE spécialistes des fonctions : nutritionnistes, hysiologistes, immunologistes.
• Ifremer, CIRAD
• Universités de Wageningen (NL), de Bohème du Sud (Tchéquie), Luke (Finlande)

Rattachement à l’école doctorale : ABIES (Agriculture Biologie, Environnement, Santé)      

Rattachement à l’Université Paris-Saclay