Les animaux d’élevage, tout comme l’Homme, hébergent en permanence des microbes. La plupart de ces microbes sont non seulement parfaitement inoffensifs, mais essentiels à la vie animale : ils réalisent des fonctions importantes sans lesquelles les animaux ne seraient pas en bonne santé. Les microbes des intestins, ou encore microbiote intestinal, sont les plus étudiés car leurs rôles sont particulièrement nombreux et importants. Nous étudions comment les variations génétiques des animaux expliquent les variations de composition en microbes observées d’un animal à l’autre. Notre objectif est d’améliorer la santé animale par la modulation des microbiotes, notamment par le biais de l’alimentation et de la sélection génétique.