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INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Liste des doctorants à partir de 2005

2023

  • Elitsa Ivanova : "La glande mammaire : Rôle de SOCS2 dans son développement et impact d’une inflammation lors de lactations successives", Soutenance le 14 mars. Direction Fabienne Le Provost

2022

  • Katy Paul : "Évolution de la diversité génétique dans des populations domestiquées de truites arc-en-ciel ". Soutenance le 22 décembre. Direction F. Phocas (GABI-GENAQUA)
  • Antoine Leduc : "Recherche, chez la vache laitière, de biomarqueurs du déficit énergétique dans le lait". Soutenance le 9 décembre. Direction M. Boutinaud - F. Le Provost (GABI-GALAC)
  • Fanny Mollandin : "Intégration d’annotations fonctionnelles dans des modèles de prédiction génomique bayésiens ». Soutenance le 28 septembre. Direction Andrea RAU (GABI – GIBBS) et Pascal Croiseau (GABI – G2B).
  • Valentin Costes : "Identification de biomarqueurs de la qualité de la semence, modélisation statistique et hypothèses biologiques" Soutenance le 24 juin. Direction Hélène Kiefer (BREED), Florence Jaffrézic (GABI).

2021

  • Anaïs Cazals : "Etude de l’impact de la génétique de l’hôte et de la composition du microbiote intestinal sur le portage de Salmonella Enteritidis chez la souris et la poule." Soutenance le 9 décembre. Direction Fanny Calenge, Jean Jaubert
  • Ronan Griot : "Développement d'outils et de méthodes de sélection génomique pour le bar et la daurade." Soutenance le 30 mars. Direction Marc Vandeputte, François Allal, Sophie Brard-fudulea.
  • Céline Bourdon : "Recherche d'associations entre microARNs, variants génétiques et QTL laitiers chez les bovins, caprins et ovins." Soutenance le 15 mars. Direction Fabienne Le Provost, Gwenola Tosser-Klopp

2020

  • Jonathan d’Ambrosio : "L’intérêt et optimisation de la sélection génomique chez la truite arc-en-ciel." Soutenance le 17 décembre. Direction Florence Phocas
  • Lidia Chavinskaia : "La vache globale. La génétique quantitative dans la globalisation de la sélection bovine." Soutenance le 16 décembre. Direction Pierre-Benoît Joly, Vincent Ducrocq
  • Anna-Charlotte Doublet : "La diversité génétique à l’ère de la génomique : évolution de la consanguinité et ses conséquences dans trois races bovines laitières françaises." Soutenance le 10 décembre. Direction Denis Laloë
  • Gwendoline David : "Structuration spatio-temporelle des communautés microbiennes dans les écosystèmes d’eau douce."  Soutenance le 9 décembre. Laboratoire Ecologie, Systematique et Evolution. Co-encadrée par Elisa Thébault et Gwendal Restoux.
  • Audrey Hulot : "Analyse de données -omiques : clustering et inférence de réseaux." Soutenance le 26 novembre. Direction : Henri-Jean Garchon, Florence Jaffrezic.
  • Sébastien Taussat : "Etude du déterminisme génétique de l’efficience alimentaire en bovins allaitants en vue d’une prise en compte dans les évaluations génomiques bovine." Soutenance le 26 juin. Direction Gilles Renand (INRAE) et Sébastien Fritz (Allice)
  • Clémentine Escouflaire: "Détection chez le bovin de polymorphismes génétiques au niveau du génome mitochondrial et des chromosomes sexuels et caractérisation de leurs effets sur les caractères de production, reproduction et santé." Soutenance le 16 juin. Direction: Hélène Hayes
  • Francesca Massacci : "Une approche intégrative pour l’étude de l’impact des antibiotiques sur le microbiote intestinal du porc et leurs alternatives pour la prévention des maladies liées à la production des porcs." Soutenance le 17 mars. Direction : Claire Rogel-Gaillard, Paolo Trevisi.
  • Marie Berodier : "Utilisation en ferme des données de génotypage pour une gestion optimisée et durable de l'élevage laitier." Soutenance le 30 janvier AgroParisTech, Paris 5e. Direction Vincent Ducrocq (thèse).

2019

  • Louise Helary : "Validation in vivo de nouveaux gènes impliqués dans le développement musculaire." Soutenance le 19 décembre, INRA Jouy-en-Josas. Direction Amandine Duchesne (INRA-GABI) et Véronique Blanquet (Université de Limoges, laboratoire Pereine). 
  • Mohammed Mesbah Uddin : "Identification of causal factors for recessive lethals in dairy cattle with special focus on large chromosomal deletions." Soutenance le 17 septembre, Université de Aarhus, Danemark, le 17 septembre 2019. Direction Just Jensen. Encadrement Goutam Sahana et Bernt Guldbrandtsen (Aarhus), Didier Boichard et Aurélien Capitan (GABI)
  • Marie-Pierre Sanchez :"Analyse génétique de la composition protéique et des aptitudes fromagères du lait de vache prédites à partir des spectres moyen infrarouge", Soutenance le 15 mai, AgroParisTech. Direction Didier Boichard.

2018

  • Thérèse Callet: "Vers l'identification des fonctions impliquées dans les capacités de différents génotypes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) à survivre et grandir avec un aliment uniquement à base de végétaux." Soutenance le 22 janvier, AgroParisTech. Direction M. Dupont-Nivet, F. Médale.
  • Gilles Monneret: "Inférence de réseaux causaux à partir de données interventionnelles". Soutenance le 15 février, Université Pierre et Marie Curie, Jussieu. Direction G. Nuel, F. Jaffrézic, A. Rau.
  • Sonia Eynard: "Utilisation des informations génomiques pour la conservation de la diversité génétique des populations domestiques." Soutenance le 23 février, WUR.  Direction M. Calus, E. Verrier, D. Laloe, G. Restoux
  • Doreen Schwochow-Thalman: "Molecular identification of colour pattern genes in birds." Soutenance le 4 mars, Faculty of Veterinary Medicine and Animal Science, Department of Animal Breeding and Genetics, Uppsala, Sweden. Direction L. Andersson (SLU), M. Tixier-Boichard (INRA), B. James Dorshorst (Virginia Tech, USA), B. Bed’Hom (INRA)
  • Mathieu Tiret: "Approche multilocus du génome dans les modèles de génétique des populations." Soutenance le 8 mars, AgroParisTech Paris. Direction F. Hospital
  • ShiZhi Wang :"Approche multilocus pour étudier la distribution des blocs de déséquilibre de liaison au sein du génome : outils génomiques dans l'étude de la biodiversité canine." Soutenance le 15 juin, AgroParisTech Paris. Direction: D. Laloë, G. Leroy
  • Jean-Noël Hubert: "Génomique des populations appliquée : détection de signatures de sélection au sein de populations expérimentales", Soutenance le 21 juin, AgroParisTech Paris-Maine, Direction F. Hospital
  • Alma Ryskaliyeva :"Variabilité de la composition protéique du lait des camélidés inter et intra espèces (c badrianus vs c dromédarius) et leurs hybrides." Soutenance le 12 juillet, AgroParisTech. Direction P. Martin
  • Andrew Marete: "Use of large-scale cow genotyping to dissect dairy complex traits beyond additive effects." Soutenue le 19 octobre, AgroParisTech, Direction D. Boichard, M. Sando Lund.
  • Gabriel Guillocheau: "Etude des polymorphismes altérant la régulation de l’expression des gènes chez le bovin." Soutenue le 19 décembre, AgroParisTech, Direction D. Rocha
  • Clémence Fraslin: "Bases génétiques de la réponse à l’infection par Flavobacterium psychrophilum chez la truite arc-en-ciel : approche expérimentale et perspectives en sélection." Soutenue le 20 décembre, AgroParisTech, Direction E. Quillet   

2017

  • Mathieu Besson: "Matching breeding goals with farming systems to enhance the sustainability of fish farming". Soutenance le 27 janvier, Wageningen University, Direction IJM (Imke) de Boer, J (Hans) Komen, Co-direction M. Vandeputte. (thèse)
  • Parsaoran Silalalhi : "Evaluation de l'effet de sélection sur l’efficacité et la robustesse chez la truie." Soutenance le 28 février, AgroParisTech. Direction Jean-Pierre Bidanel. (thèse)
  • Pauline Michot (Cifre Allice) :"Utilisation des séquences de génome complet pour l'identification de mutations délétères responsables d'anomalies génétiques récessives chez le bovin.".  Soutenance le 29 Mars, AgroParisTech. Direction D. Boichard, A. Capitan
  • Iola Croué: "Évaluation génétique et génomique de nouveaux caractères en bovins laitiers." Soutenance le 14 novembre, AgroParisTech. Direction V. Ducrocq. (thèse)
  • Zih-Hua Fang : The genetic background of bovine αs1- and αs2-casein phosphorylation". Soutenance le 15 décembre, AgroParisTech. Direction P.Martin, M.Visker (WU) (thèse)
  • Tatiana Maroilley : "Génétique et Génomique de la capacité immunitaire chez le porc : approches eQTL et étude de biomarqueurs sanguins". Soutenance le 21 décembre, INRA IDF-Jouy-en-Josas. Direction C. Rogel-Gaillard (thèse)
  • Ching-Yi Lien: "QTL Mapping for Production Traits in a Cross between Taiwan Country Chicken and an Experimental Line of Rhode Island Red Layers”. Soutenance le 20 décembre, à Taichung. Direction M. Tixier-Boichard, Chen Chih-Feng, Université nationale Chung Hsing de Taiwan (NCHU).                                                                                                

2016

  • Belén Jiménez Mena: "Estimation of the effective population size (Ne) and its application in the management of small populations", soutenance le 21 janvier, AgroParisTech, Direction Frédéric Hospital (Inra), Thomas Bataillon (AU)
  • Alexis Michenet: "Détection de QTL et sélection génomique des qualités maternelles des vaches allaitantes", soutenance le 14 octobre, AgroParisTech, Direction Florence Phocas
  • Dávid Jónás: "Evaluation des performances des méthodes de sélection génomique basées sur des haplotypes et intérêt de ces approches dans un contexte multiracial." Soutenance le 12 décembre, Inra Jouy en Josas. Direction P. Croiseau, V. Ducrocq

2015

  • Lenha MOBUCHON: "L'impact des microARNs sur la lactation et leur régulation nutritionnelle dans la glande mammaire", soutenance le 16 Décembre, Inra de Jouy-en-Josas, Direction Christine Leroux
  • Mélina GALLOPIN: "Classification et inférence de réseaux pour les données RNA-seq", soutenance le 9 décembre 2015, Faculté des sciences d'Orsay, Direction F.Jaffrezic, G.Celeux (thèse)
  • Edin HAMZIC: "Bases génétiques des réponses à deux agents pathogènes majeurs des poulets de chair et poules pondeuses", soutenance le 8 décembre 2015,  AgroParisTech, Direction MH. Pinard-van der Laan, B.Bed'Hom, H.Juul-Madsen (U.Aarhus)
  • Sophie BRARD: "Quel cadre théorique et pratique pour l'utilisation de la sélection génomique dans l'amélioration génétique des chevaux ?", soutenance le 8 octobre 2015, Inra Castanet-Tolosan, Direction A. Ricard (résumé)
  • Charlotte DEZETTER: "Évaluation de l’intérêt du croisement entre races bovines laitières", soutenue le 6 octobre 2015, Direction: Henri Seegers, INRA Angers-Nantes (résumé)
  • Irene VAN DEN BERG : "Utilisation des données de séquençage du génome complet en sélection génomique bovine" soutenance le 7 septembre, AgroParisTech Paris, Direction Didier Boichard & M.Lund (DK)
  • Nada MAHJOUB : "Génomique fonctionnelle du virus de la pseudorage chez le cochon : un modèle pour les études d'interaction hôte-pathogène" soutenance le 13 mai, INRA Jouy en Josas, Direction  Elisabetta Giuffra (résumé)

2014

  • Chris HOZE : "Développement d'évaluations génomiques multiraciales chez les bovins laitiers" soutenance le 19 Juin, AgroParisTech Paris, Direction Vincent Ducrocq
  • Cathy HUE-BEAUVAIS : "Périodes critiques pour la croissance et le développement mammaire lors d'une alimentation obésogène chez la lapine et la souris : Implication de la leptine", soutenance le 16 Décembre, INRA Jouy-en-Josas, Direction Eve Devinoy
  • Vincent JACQUIER: "Approches génomiques des interactions entre l’implantation du microbiote digestif chez le lapereau et la maturation du système immunitaire" soutenance le 11 décembre 2014 à INPT Toulouse, INPT , direction: Thierry Gidenne et Claire Rogel-Gaillard (résumé)

2013

  • Clémence DESJARDIN : "Bases moléculaires et physiopathologiques de l'ostéochondrose équine", soutenance le 8 octobre, direction Edmond Cribiu
  • Sandrine LE GUILLOU : "Du miRNome au rôle de miR-30b : implication des microARN dans la glande mammaire." soutenance le 20 mars, direction Edmond Cribiu
  • Thierry TRIBOUT : "Intérêt de la sélection génomique dans les programmes de sélection porcins : cas d'une lignée mâle de grande taille", Thèse (pdf) soutenance le 1er octobre, direction Florence Phocas, Catherine Larzul
  •  Eloi VERRIER : "Analyse des mécanismes de résistance génétique aux infections chez la truite arc-en-ciel",Thèse (pdf) soutenance le 9 janvier, direction Edwige Quillet (GABI) et Pierre Boudinot (VIM), Médaille d'argent 2013 de l'Académie de l'Agriculture de France
  • Cédric MEERSSEMAN : "Identification et caractérisation de promoteurs bidirectionnels au sein du muscle squelettique de l'espèce Bos taurus". Thèse, Soutenue le 16 décembre à Limoges, Encadrement D. Rocha, D. Petit.

2012

  • Pauline BRENAUT : "Analyse fonctionnelle des mécanismes protecteurs des épithéliums (mammaire et intestinal) induits par une protéine de la phase aiguë de la réaction inflammatoire : la Sérum Amyloïde A3", soutenance le 4 décembre, direction Patrice Martin
  • Laurine BUSCARA : "Rôle de l’alpha-lactalbumine et de la matrice extracellulaire dans la biologie de la glande mammaire", direction Kevin Nicholas (Deakin University, Australie), Fabienne Le Provost  
  • Coralie DANCHIN-BURGE : "Combinaison de stratégies in situ et ex situ pour la gestion durable de la variabilité génétique des populations animales"soutenance le 29 novembre
  • Romain DASSONNEVILLE : "Sélection génomique chez les bovins laitiers"soutenance le 28 septembre, direction Didier Boichard et Vincent Ducrocq
  • Mélanie GUNIA-JAQUOT : "Conception et optimisation d’un programme de sélection de petits ruminants en milieu tropical : cas du caprin Créole en Guadeloupe", thèse (pdf) soutenance le 16 mai 2012, direction MANDONNET Nathalie (URZ Guadeloupe), PHOCAS Florence
  • Bérénice HUQUET : "Adaptation de la sélection à la diversité des systèmes d’élevages en bovins laitiers",Thèse (pdf) soutenance le 8 octobre
  • Bruno PASSET : "Le poisson zèbre : un modèle d’études des maladies à Prions ?" soutenance le 17 décembre, direction Jean-Luc Vilotte (résumé)
  • Romain SAINTILAN : "Etude de nouvelles approches pour la sélection sur l'efficacité alimentaire chez le porc en croissance et des perspectives de leur mise en place" soutenance du 9 novembre, direction Pierre Sellier et Hélène Gilbert
  • Marc VANDEPUTTE : "Etude des variations génétiques de la croissance et du sex-ratio chez le bar à partir de pedigrees moléculaire"Thèse (pdf) soutenance le 4 octobre

2011

  • Sophie ALLAIS : "Détection et validation de marqueurs génétiques impliqués dans la qualité de la viande bovine" Thèse (pdf), soutenue le 4 mars 2011, direction Gilles Renand
  • Didier BOUCHEL : "Caractérisation et cartographie des ressources génétiques caprines du Sénégal à l'aide d'indices morphométriques et de marqueurs moléculaires" soutenue le 1er février 2011, direction Bernard Bibé (SAGA, Toulouse) et Xavier Rognon (PSGen).
  • Chi-Sheng CHANG : "A global approach of chicken genetic diversity in Taiwan combining phenotypes and molecular markers" soutenue le 24 mars 2011, direction Michèle Tixier-Boichard
  • Mathieu DIRIBARNE : "Identification du gène et de la mutation causale du gène REX chez le lapin" soutenue le 16 mai 2011, direction Gérard Guérin
  •  Rui HU : "Etude des gènes de classe I non classiques du complexe majeur d’histocompatibilité chez le porc" soutenue le 13 mai 2011, direction Claire Rogel-Gaillard
  • Manal KHALIFE : "Etude du rôle biologique de la protéine prion et de sa région polybasique par étude transcriptomique et par développement de souris transgénique" (notice), soutenue le 8 novembre 2011, direction Jean-Luc Vilotte
  • Richard LE BOUCHER :"Génétique de l’utilisation de produits d’origine végétale chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) et le bar européen (Dicentrarchus labrax)", thèse (pdf) soutenue le 16 décembre 2011, direction Edwige Quillet et Béatrice Chatain
  • Clotilde PATRY : "Impacts de la sélection génomique sur les évaluations génétiques classiques"Thèse (pdf), soutenue le 9 décembre,  direction Vincent Ducrocq, Prix de thèse AFZ 2011
  • Btissam SALMI : "Méta-analyse et analsye multidimensionnelle : applications à la qualité de la viande de porc" soutenue le 2 décembre, direction Jean-Pierre Bidanel
  • Simon Teyssèdre : "Dissection génétique des caractères par analyse de liaison et d'association : aspects méthodologiques et application à la sensibilité à l'ostéochondrose chez les Trotteurs Français", Thèse (pdf) soutenue le 14 novembre 2011, Direction Jean-Michel Elsen, Anne Ricard

 

2010

  • Nisrine BOUMAHROU : "Recherche de facteurs intestinotrophiques dans le lait des souris PRM/Alf" soutenue le 5 novembre 2010, direction Sylvain Bellier & Patrice Martin
  • Aurélien CAPITAN : "Détection et caractérisation de loci responsables d'anomalies de cornage en race Charolais français" (thèse confidentielle), soutenue le 2 avril 2010, direction : André Eggen
  • Olympe CHAZARA : "Diversité génétique structurale et fonctionnelle du CMH chez le poulet : implication pour la résistance aux maladies"soutenue le 16 mars 2009, direction Michèle Tixier-Boichard, Bertrand Bed’Hom
  • Laure GRIMA : "Vers une sélection de l’efficacité d’utilisation de l’aliment chez le poisson" Thèse (pdf), soutenue le 24 mars 2010, direction Muriel Mambrini, Béatrice Chatain
  • Charles PERRIER : "Fonctionnement des métapopulations de poissons migrateurs anadromes : Application au saumon atlantique (Salmo salar) dans la Baie du Mont Saint Michel et implication pour la gestion" soutenue le 10 décembre 2010, direction Ourry A., Baglinière J.L., Guyomard R.
  • Andrea RAU : "Inférence rétrospective de réseaux de gènes à partir de données génomiques temporelles"thèse (pdf) soutenue en 2010, direction Rebecca Doerge, Florence Jaffrezic, Jean-Louis Foulley
  • Nezha SDASSI : "Etude de l’implication des miARNs dans le développement de la glande mammaire de souris" soutenue le 3 février 2010, direction Fabienne Le Provost

 

2009

  • Slim BEN JEMAA : "Cartographie fine de QTL de fertilité femelle chez les bovins laitiers français". Thèse (pdf) soutenue le 5 mars 2009, direction André Eggen, Mathieu Gautier
  • Alban BOUQUET : "Amélioration de l’efficacité des programmes de sélection des bovins allaitants: de nouveaux modèles d’évaluation génétique"Thèse (pdf) soutenue le 9 septembre 2009, direction Florence Phocas, Gilles Renand
  • Félicie FAUCON : "Identification, chez les ruminants, des gènes et réseaux de gènes impliqués dans la différenciation et le fonctionnement de la glande mammaire"Thèse (pdf) soutenue le 26 mars 2009, direction Patrice Martin
  • François GUILLAUME : "Intégration de l'information moléculaire dans l'évaluation génétique" soutenue le 6 octobre 2009, direction Didier Boichard, Tom Druet
  • Guillemette MAROT : "Modélisation statistique pour la recherche de gènes différentiellement exprimés: modèles de variance-covariance, analyse séquentielle et méta-analyse"Thèse (pdf) soutenue le 11 décembre 2009, direction Florence Jaffrezic, Jean-Louis Foulley, Claus-Dieter Mayer

 

2008

  • Bouabid BADAOUI : "Polymorphisme de la caséine AlphaS1 et profils d’expression dans les cellules épithéliales mammaires" soutenue le 2 octobre 2008(Barcelone), direction Marcel Amills (Universitat Autonoma de Barcelona), co-encadrant Patrice Martin
  • Cécile BERTHOULY : "Caractérisation des populations de bovins, de buffles et de poulets dans une région montagneuse du Vietnam, la province de Ha Giang" Thèse (pdf) soutenue le 23 mai 2008, direction Etienne Verrier, Jean-Charles Maillard
  • Mylène DUVAL : "Modélisation et estimation de variances hétérogènes dans les modèles non linéaires mixtes". Thèse (pdf) soutenue le 8 décembre 2008,direction Jean-Louis Foulley, Christèle Robert-Granier
  • Jean-Claude FOTSA : "Caractérisation des populations de poules locales (Gallus gallus) des Zones des Hauts Plateaux de l’Ouest et de la Forêt Dense Humide du Cameroun"Thèse (pdf) soutenue le 16 décembre 2008, direction Etienne Verrier, Yacouba Manjeli, André Bordas, Xavier Rognon
  • Micaela GALLOZZI : "L'analyse du rôle de cellule spécifique, la reproduction et-ou de la propagation d'agent infectieux TSE" soutenue 2008(programme RIVAGE), Direction Jean-Luc Vilote
  • Bérénice HERSZBERG : "Etude de la myopathie héréditaire par surcharge en polysaccharides chez les chevaux Cob normand" Thèse (pdf) soutenue le 11 décembre 2008, direction Gérard Guérin
  • Zuzana KRUPOVA : "Facteurs génériques qui déterminent la qualité du lait de brebis" (Faculty of Biotechnology and Food Science, Slovak Agricultural University of Nitra, Slovaquie), soutenue le 5 juin 2008, direction Prof Josef Bulla, Patrice Martin
  • Hélène LECLERC : "Mise en place de l'évaluation génétique sur les contrôles élémentaires en bovins laitiers et perspectives d’utilisation des résultats en appui technique"Thèse (pdf) soutenue le 19 décembre 2008, direction Vincent Ducrocq
  • Grégoire LEROY : "Diversité génétique et gestion génétique des races canines"Thèse (pdf) soutenue le 30 mai 2008, direction Xavier Rognon, Etienne Verrier
  • Florian RAMBOW : "Etude du mécanisme de régression spontanée des mélanomes cutanée chez le porc MeLiM"Thèse (pdf) soutenue le 14 mai 2008, direction Patrick Chardon, Encadrement Silvia Vincent-Naulleau
  • Catherine RUHLMANN : "Vers une évaluation génétique internationale des chevaux pour les performances en saut d’obstacle" soutenue le 17 novembre 2008, direction Anne Ricard, Eduardo Manfredi, Co-encadrement Gérard Guerin
  • Florence YTOURNEL : "Déséquilibre de liaison et cartographie de QTL en population sélectionnée" Thèse (pdf) soutenue le 28 janvier 2008, direction Hélène Gilbert, Didier Boichard

2007

  • Szilvia BATORINE-KUSZA : "Evolution des gènes du système MHC chez les mammifères" soutenue en 2007, co-encadrant Claire Rogel-Gaillard (Programme RIVAGE)
  • Leonardo BIANCHI : "Approccio proteomico alla caratterizzazione del latte ovino : infezione sperimentale della mammella in pecore a diversi livelli di cellule somatiche" soutenue le 23/01/2007,  direction Prof. Carmen Casoli, co-encadrant Patrice Martin (Università degli Studi di Perugia)
  • Clotilde DUBOIS : "Modélisation des programmes de sélection dans l’élevage du cheval de sport" Thèse (pdf) soutenue le 6 décembre 2007, direction Anne Ricard, Eduardo Manfredi
  • Anne LAUVIE : "Gérer les populations animales locales à petits effectifs : Approche de la diversité des dispositifs mis en œuvre"  Thèse (pdf), soutenue le 15 juin 2007, direction Annick Audiot, Etienne Verrier, Médaille d'argent de l'Académie d’Agriculture de France 2008
  • Valérie LOYWYCK : "Approches multicritères de l'évolution de la variabilité génétique et de la taille efficace au sein des populations animales soumises à sélection" Thèse (pdf) soutenue le 18 décembre 2007, direction Etienne Verrier, Piter Bijma, Marie-Hélène Pinard-van der Laan, Jacques David
  • Valentina MARIANI : "Analyse des modifications du transcriptome dans un modèle d’infection de cellules dendritiques porcines par le PrV" soutenue le 18 Mars 2007, direction Elisabetta Giuffra (PTP, Lodi), encadrement Claire Rogel-Gaillard et Laurence Flori (Programme RIVAGE, Université de Milan, Italie). 
  • Giulietta MINOZZI : "Caractérisation de lignées de poulets sélectionnés sur la réponse immunitaire: croisement et résistance aux maladies" soutenue le 27 Novembre 2007,direction Marie-Hélène Pinard-van der Laan, Francis Minvielle (Programme RIVAGE)
  • Adalberto ROSENDO PONCE : "Approches quantitatives et moléculaires de l’analse de la variabilité génétique des performances de reproduction des truies" soutenue le 27 mars 2007, direction Jean-Pierre Bidanel
  • Licia SILVERI : "Two different aspects of genomics : the construction of a high-density radiation hybrid map and the study of the involvement of miRNAs in the mammary gland" soutenue le 15 février 2007, direction Lorenzo Morelli, Fabienne Le Provost

2006

  • Laurianne CANARIO : "Variabilité génétique de la survie des porcelets en allaitement. Relations avec les aptitudes maternelles des truies" Thèse (pdf) soutenue le 7 juin 2006 direction Jean-Pierre Bidanel, Médaille d'argent de l'Académie d’Agriculture de France 2007
  • Chung-Ming CHANG : "Génétique moléculaire de la coloration chez le poulet : étude du gène de la tyrosinase et identification de la base moléculaire de la mutation ‘blanc récessif’" soutenue le 6 Février 2006, direction Michèle Tixier-Boichard
  • Amandine DUCHESNE-COLLARDOT : "Approche moléculaire des maladies génétiques chez les ruminants" soutenue le 6 juillet 2006, encadrant André Eggen
  • Szilvia KUSZA : "Expression et polymorphisme des gènes SLA-Ib du porc" soutenue le 13 octobre 2006, direction Andras Javor, encadrement en France Claire Rogel-Gaillard (Programme RIVAGE, Université de Debrecen, Hongrie)
  • Aya Lydie N’DRI : "Etude des interactions entre génotype et environnement chez le poulet de chair et la poule pondeuse" Thèse (pdf) soutenue le 9 mai 2006,direction Sandrine Mignon-Grasteau, MichéleTixier-Boichard

2005

  • Etienne BEZAULT : "Étude du système de déterminisme du sexe au sein de populations naturelles de tilapia du Nil, Oreochromis niloticus : importance des composantes génétiques et environnementales" soutenue le 5 Décembre 2005, direction Bernard Chevassus-Au-Louis, Médaille d'argent de l'Académie d’Agriculture de France 2006
  • Céline CHANTRY-DARMON : "Construction d’une carte intégrée génétique et cytogénétique chez le lapin européen (Oryctolagus cuniculus) : application à la primo localisation du caractére rex" soutenue le 29 avril 2005, direction Patrick Chardon, co-encadrement Hélène Hayes et Claire Rogel-Gaillard
  • Katia CHARLES : "Relations entre les formes migratrices marine et résidente de la truite commune (Salmo trutta L.) : approches génétique et écologique" soutenue en 2005 
  • Rachida HADAOUI-HAMMOUTENE : "Etude des Interactions entre caséines aux interfaces : approche biophysique de la dynamique d’assemblage des micelles" soutenue le 28 novembre 2005, direction Sylvie Beaufils (CNRS), Patrice Martin (INRA)
  • Ondrej MALEK : "Analyse moléculaire de la progression et régression tumorale dans le modèle MeLiM" soutenu en 2005, co-direction Claudine Geffrotin (Programme RIVAGE, Université de Prague)