Thématique globale 

Allier génétique et physiologie pour obtenir des poissons robustes et efficients dans des environnements variés et fluctuants. Depuis 2016, nous travaillons également sur l’abeille.

Résultats marquants

• Estimation des valeurs économiques et environnementales des caractères sélectionnés
• Architecture génétique des caractères clés pour une aquaculture durable : production de connaissance et transfert à la profession
• Coordination du projet Infrastructures Européen AQUAEXCEL2020

1- Architecture génétique des caractères d’efficience

Nous nous focalisons sur les caractères d’efficience qui amélioreront le pilier économique du développement durable mais aussi les piliers environnementaux et sociaux.
- Efficacité alimentaire
  Projets associés : H2020 Embric, PerformFish, AquaImpact.
- Résistance aux maladies : bases génétiques et fonctionnelles de la résistance aux maladies virales et bactériennes.
  Projets associés : H2020 Aqua-Faang ; FEAMP SG-Truite et Gènesea.
- Profil d’acides gras du muscle
  Projet associé : FEAMP OmegaTruite
- Allocation des ressources : interactions entre caractères d’efficience et avec les caractères fonctionnels (santé, immunité, réponse au stress, comportement, reproduction …). Thème en développement.

2- Physiologie et génétique de la réponse à des stress environnementaux ou d’élevage

Nous combinons des approches physiologiques, comportementales, génétiques et épigénétiques pour étudier les réponses à différents stress.
- Adaptation aux nouveaux aliments, notamment les aliments végétaux :
   Projets associés : FUI Ninaqua, FEAMP AntiOb
- Adaptation à la température, sensibilité à l’environnement et épigénétique, variabilité génétique des marques épigénétiques.
   Projet associé : H2020 AQUAEXCEL2020, FEAMP Epicool.
- Conséquences à long terme d’événements précoces : conséquences, y compris transgénérationnelles, de l’exposition à des stress thermiques ou à des polluants.
   Projets associés : Sushifish, Ephemare, PlasticSeine
- Déterminisme génétique et environnemental du sexe: génétique de la masculinisation spontanée (truite). Identification des néomâles avec les prédictions génomiques ; lien phénotype sexuel - modification d’expression de gènes candidats ou de marques épigénétiques (bar)
   Projets associés : FEAMP Neobio, 3S, ERANet Sushifish, H2020 AQUAEXCEL2020

3 – Gestion des populations sélectionnées

- Sélection génomique: intérêt et optimisation de la sélection génomique pour différents caractères et différentes espèces (truite, bar et daurade)
  Projets associés : FEAMP SG-Truite et GèneSea, deux thèses CIFRE
- Modélisation des schémas de sélection chez l’abeille : mise en oeuvre de programmes de sélection efficaces pour améliorer la production (gelée royale ou miel), le comportement des abeilles et leur santé.    
  Projet associé : Beestrong
- Nouvelles technologies de reproduction : transplantation de cellules souches et cryoconservation.
   Projet associé : FEAMP Biogerm

Nous continuons aussi à développer des ressources génomiques.

• Piscicultures expérimentales : INRA : PEIMA (Sizun) et IERP(Jouy en Josas), Ifremer Palavas
• Ressources génétiques originales développées par l’équipe
• Cellule Bioinformatique GABI, Sigenae et plateformes de génomique : GeT-Plage, @BRIDGe, Gentyane).

• Professionnels de la sélection piscicole et apicole : SYSAAF (Syndicat des sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), ITSAP- Institut de l’Abeille, sélectionneurs
• Collègues INRA spécialistes des fonctions : nutritionnistes, hysiologistes, immunologistes.
• Ifremer, CIRAD
• Universités de Wageningen (NL), de Bohème du Sud (Tchéquie), Luke (Finlande)

• Rattachement à l’école doctorale : ABIES (Agriculture Biologie, Environnement, Santé)      
• Rattachement à l’Université Paris-Saclay