En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal AgroParisTech Université Paris-Saclay SAPS - Sciences Animales Paris-Saclay

Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Génomique, Biodiversité, Bioinformatique, Statistique

Animation: Denis Laloë

Equipe_GiBBS_2020

Expertises 

Génétique et génomique des populations ; méthodes de gestion des ressources génétiques in situ et ex situ ; expérimentation animale ; biostatistique ; analyse de données ; bio-informatique.

Thématique globale 

L’équipe conduit des recherches méthodologiques en génétique, bioinformatique et biostatistique, en ancrant celles-ci dans des problématiques concrètes et des études appliquées, réalisées au sein de l’équipe ou via des collaborations.

Résultats marquants

  • Organisation du Colloque “Deep Learning et Génomique”
  • Regeneration Rosetta : application web « Expression de gènes et accessibilité de la chromatine » (2019)
  • Diversité et progrès génétique dans les races laitières à partir des ROH (2019)

Questions scientifiques

1- Biodiversité, ressources génétiques et génétique des populations

Nous couvrons l’ensemble des domaines liés à la diversité génétique et aux ressources génétiques. Nous intervenons dans la caractérisation de la diversité de différentes espèces, la valorisation et la gestion, pour les races menacées et les races à grand effectif en lien avec la sélection génomique, et les ressources cryoconservées. Enfin, nous sommes engagés dans des réseaux de coopération internationale, en lien avec la FAO.

  •    Projets associés : GDivSelGen (Métaprogramme SELGEN) ; IMAGE & GenResBridge (Europe H2020).

2- Biostatistique et bioinformatique

Nos activités en biostatistique et bioinformatique sont doublement orientées. D’une part, nous développons des méthodes (statistique Bayésienne, inférence de réseaux, méthodes multivariées), des logiciels et des ‘‘pipe-lines’’ (Variant calling, annotation, détection de SV) pour les analyse de données xomiques et leur interprétation. D’autre part, nous apportons un appui et du conseil en statistique et bio-informatique pour les biologistes, à l’intérieur comme à l’extérieur de l’unité.

  •     Projets associés : EnorPREG (ANSES) ; BioMARQ’LAIT (CASDAR) ; RECEPT (ApisGene)

3 – Expérimentation animale et lignées expérimentales

L’expérimentation sur les volailles (poule, caille) est réalisée dans le cadre d’expériences de sélection de long terme sur l’efficacité alimentaire, la production d’œufs et la capacité d’adaptation. L’équipe maintient un nombre conséquent de populations de poules pour leur intérêt biologique et génétique. L’ensemble de ces populations est utilisé comme modèle dans des études de génomique fonctionnelle ou de génomique des populations.

  •    Projets associés : ChickStress (ANR)

Dispositifs de recherche

  • Bases de données nationales et données collectées sur le terrain.
  • Unité expérimentale volailles (PEAT, Nouzilly).
  • Réseau de Centres de ressources biologiques (CRB- CRB-Anim, projet Infrastructure).
  • Collaborations et partenaires
  • Europe : projet Image sur les infrastructures de cryopréservation ; projet GenResBridge sur les ressources génétiques des animaux, plantes et forêts
  • Europe, Taiwan : Etudes de génétique et génomique des populations sur la volaille (poulet, cailles) ;
  • Afrique, Inde : Etudes de génétique des populations sur des populations locales de bovins, poules, pintades ;
  • USA : Biostatistique, Intégration et visualisation de données.
  • Rattachement à l’école doctorale : ABIES (Agriculture Biologie, Environnement, Santé)      
  • Rattachement à l’Université Paris-Saclay