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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Synergie entre recherche et amélioration génétique

Si l’activité du département de génétique animale a toujours fortement pris en compte les besoins de l’amélioration génétique, l’objectif a toujours été la recherche d’une synergie entre recherche et amélioration. Cette stratégie a été favorable à la recherche en créant des conditions propices à son développement.

Ainsi, nos recherches en évaluation génétique ont conduit à des avancées en statistiques, par exemple dans l’analyse des caractères discrets, des variances hétérogènes, des séries chronologiques ou dans l’analyse de survie, avec des retombées dans des domaines très variés. Autre exemple, les bases nationales du CTIG constituent une source d’information majeure, qui permet l’analyse de la variabilité génétique des caractères et la recherche de gènes majeurs et de QTL, la recherche d’interaction génotype x milieu, l’analyse de la diversité génétique et de la dynamique des populations. Dans un cadre plus pluridisciplinaire, elles contribuent à des études d’épidémiologie ou de systèmes de production. D’une façon générale, elles sont une forme de phénotypage à haut débit en termes de nombre d’animaux, même si l’information par animal reste inévitablement limitée. Elles donnent accès à des animaux extrêmes et c’est ainsi par exemple qu’à partir de la Gestion Technique des Troupeaux de Truies ont été créées les lignées hyperprolifiques porcines ou qu’ont été détectées beaucoup d’anomalies chromosomiques induisant une hypoprolificité. Pour les caractères peu héritables comme la fertilité, grâce aux effectifs disponibles et à la structure des populations, elles constituent la voie la plus efficace, si ce n’est la seule, pour disposer d’individus génétiquement bien caractérisés.

De nombreux protocoles de recherche ont ainsi été greffés directement sur les dispositifs nationaux de sélection : plusieurs lignées sélectionnées de façon divergente ont été constituées en domaine expérimental en profitant de reproducteurs extrêmes sélectionnés dans les populations nationales (lignées bovines Holstein et Charolaise) ; plusieurs programmes de détection de QTL, parmi les plus importants au monde, ont été construits à partir des bases nationales ; de nombreux dispositifs sont mis en place dans les stations de contrôle (programme Qualvigène sur la qualité de la viande bovine par exemple) qui constituent par ailleurs la seule possibilité, hors troupeaux expérimentaux, de phénotyper pour des caractères complexes à mesurer comme la résistance aux parasites ou le comportement.

Dans les années récentes, le programme bovin de sélection génomique est un exemple très illustratif de synergie entre recherche et applications : ce programme apporte aux chercheurs de nombreuses informations (phénotypes, pedigrees, génotypes pour de nombreux marqueurs, échantillons d’ADN) concernant d’importants effectifs des principales races bovines, qui sont une ressource unique pour la caractérisation de QTL. Il ancre fortement les professionnels utilisateurs et financeurs dans l’accompagnement de l’innovation.

En retour, au-delà des évaluations génétiques, de nombreuses applications dérivées de ces recherches ont été proposées aux sélectionneurs.