Logiciels et outils

Développements méthologiques et outils

Les outils dont disposent les généticiens ont beaucoup évolués. Une préoccupation majeure consiste à étudier les concepts et développer des outils performants pour conduire les sujets de recherche.

Dans ce dossier

Le Kit de Survie permet d'analyser des fichiers de très grande taille, de traiter des modèles complexes incluant des variables dépendant du temps, et de prédire des effets aléatoires et d'estimer des composantes de variance.
Pedig est un logiciel Fortran développé pour l’analyse de grandes populations
Ces programmes mettent en œuvre divers aspect de la méthode de Weitzman (1992) de mesure de la diversité entre populations connaissant les distances entre celles-ci.
Les fichiers suivants fournissent des pistes d'annotation qui peuvent être utilisées comme source externe de données d'annotation dans les navigateurs de génome (UCSC, Ensembl).
HTS Filter, metaRNASeq, HTS Cluster, ebdbNet.

Date de modification : 24 octobre 2023 | Date de création : 23 février 2010 | Rédaction : P. Huan