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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Genetique Animale et Biologie Integrative

Unité Mixte de Recherche INRA AgroParisTech GABI Génétique Animale et Biologie Intégrative

Elisabetta GIUFFRA, Directeur de Recherche

E. Giuffra
Génomique des interactions hôte (porc)-virus et annotation fonctionnelle des génomes des principales espèces d'élevage.

 

INRAE, UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative
Domaine de Vilvert, Bat 320, 78352 Jouy en Josas
Tel : +33 (0) 1 34 65 26 48 

Email : elisabetta.giuffra@inrae.fr

Équipe GeMS : Génétique, Microbiote, Santé

 CV :

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-9568-2056

Je suis biologiste et j’ai obtenu mon doctorat en génétique moléculaire à l'Université de Turin (Italie) en 1993. Depuis, j’ai travaillé sur différents sujets liés à la génomique des animaux d'élevage en Italie, en France, en Suède et au Royaume-Uni.

J’ai rejoint l’INRAE en décembre 2010, où j’ai continué et approfondi mes recherches sur la génomique de la réponse de l’hôte aux agents pathogènes, en particulier l’interaction porc-virus, par des approches de génomique transcriptionnelle. Depuis ma prise de fonction de DR2 en février 2015 je travaille en priorité dans le contexte de l’annotation fonctionnelle des génomes des espèces d’élevage et je co-dirige le comité de direction de FAANG (« Functional Annotation of Animal Genomes » ; www.faang.org). Je coordonne un projet européen (H2020 GENE-SWitCH « The regulatory GENomE of SWine and CHicken: functional annotation during development » ; www.gene-switch.eu) et je m’intéresse aux systèmes in vitro (en particulier les organoïdes) pour l’étude des relations génotype - phénotype et pour le phénotypage des caractères liés à la réponse immunitaire des populations porcines

Domaines de recherche : 

 Interaction hôte-pathogène – Annotation fonctionnelle des génomes des animaux domestiques.

Publications :

Intestinal organoids in farm animals. Veterinary research

2021-02-25 | journal-article

Distinctive Cellular and Metabolic Reprogramming in Porcine Lung Mononuclear Phagocytes Infected With Type 1 PRRSV Strains. Frontiers in immunology

2020-12-07 | journal-article

An integrative atlas of chicken long non-coding genes and their annotations across 25 tissues. Scientific reports

2020-11-24 | journal-article

From FAANG to fork: application of highly annotated genomes to improve farmed animal production. Genome biology

2020-11-24 | journal-article

Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals.

BMC Biology

     2019-12-30 | journal-article

Macrophage-B Cell Interactions in the Inverted Porcine Lymph Node and Their Response to Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus. Frontiers in immunology

    2019-05 | journal-article

  • PMID: 31130951
  • PMC: PMC6510060
  • DOI: 10.3389/fimmu.2019.00953

The miRNA-targeted transcriptome of porcine alveolar macrophages upon infection with Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus. Scientific reports

    2019-02 | journal-article

  • PMID: 30816147
  • PMC: PMC6395673
  • DOI: 10.1038/s41598-019-39220-3

Functional Annotation of Animal Genomes (FAANG): Current Achievements and Roadmap. Annual review of animal biosciences

    2018-11 | journal-article

  • PMID: 30427726
  • DOI: 10.1146/annurev-animal-020518-114913

Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Type 1.3 Lena Triggers Conventional Dendritic Cells 1 Activation and T Helper 1 Immune Response Without Infecting Dendritic Cells. Frontiers in immunology

    2018-10 | journal-article

  • PMID: 30333837
  • PMC: PMC6176214
  • DOI: 10.3389/fimmu.2018.02299

Long noncoding RNA repertoire in chicken liver and adipose tissue. Genetics, selection, evolution : GSE

    2017-01 | journal-article

  • PMID: 28073357
  • PMC: PMC5225574
  • DOI: 10.1186/s12711-016-0275-0

GO-FAANG meeting: a Gathering On Functional Annotation of Animal Genomes. Animal genetics

    2016-07 | journal-article

  •  PMID: 27453069
  •  PMC: PMC5082551
  •  DOI: 10.1111/age.12466

Coordinated international action to accelerate genome-to-phenome with FAANG, the Functional Annotation of Animal Genomes project. Genome Biology

    2015-03 | journal-article

  •  PMID: 25854118
  •  PMC: PMC4373242
  •  DOI: 10.1186/s13059-015-0622-4

Impact of the genetic background on the composition of the chicken plasma MiRNome in response to a stress. PloS one

    2014-12 | journal-article

  • PMID: 25473826
  • PMC: PMC4256448
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0114598

A 2.5-kilobase deletion containing a cluster of nine microRNAs in the latency-associated-transcript locus of the pseudorabies virus affects the host response of porcine trigeminal ganglia during established latency. Journal of virology

    2014-10 | journal-article

  •  PMID: 25320324
  •  PMC: PMC4301172
  •  DOI: 10.1128/JVI.02181-14