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UMR 1313 Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI)
Domaine de Vilvert, 78350 Jouy-en-Josas
Tel : +33 (0) 1 34 65 22 01  ou +33 (0) 6 46 00 46 25

Email : claire.rogel-gaillard@inrae.fr

Claire Rogel-Gaillard est directrice de recherche à INRAE (DR1). Ses travaux de recherche actuels portent sur la caractérisation et la prédiction de la compétence immunitaire et de la réponse à la vaccination chez les animaux d’élevage, en particulier chez le porc. Elle conduit des projets qui associent phénotypage de paramètres immunitaires et de production, génétique, génomique fonctionnelle et métagénomique, dans une perspective d’intégration des données pour comprendre les mécanismes biologiques et identifier des marqueurs génétiques et des biomarqueurs. Elle a participé au projet de séquençage du génome du porc et du lapin et a coordonné, en collaboration avec le BGI-Shenzhen et l’université de Copenhague, la construction du premier catalogue de gènes du microbiome intestinal du porc. Dans un contexte de transition agroécologique, elle contribue aux réflexions et propositions qui visent à concrétiser des approches liées à la santé globale (Un Monde, une Santé), en interaction avec les communautés scientifiques qui travaillent sur l’Homme, les animaux, les plantes et l’environnement.

Claire Rogel-Gaillard a été conseillère scientifique auprès de la Présidence de l’INRA (2011-2012). Elle a dirigé pendant huit ans (2013-2020) l’unité mixte de recherche INRAE-AgroParisTech GABI (Génétique Animale et Biologie Intégrative) basée à Jouy-en-Josas. Elle a lancé puis coordonné pendant six ans (2015-2020) Sciences Animales Paris-Saclay, un réseau interdisciplinaire dédié aux sciences de l’animal, qui associe des unités rattachées à l’université Paris-Saclay et à l’Université Paris-Est (Ecole Vétérinaire de Maisons Alfort).

Depuis 2021, elle est Directrice scientifique adjointe Agriculture d’INRAE et directrice adjointe pour la recherche de la graduate school Biosphera de l’Université Paris-Saclay.

CV :

• Ingénieur agronome AgroParisTech (ex INA-PG, promotion 1984)
• Docteur-ingénieur AgroParisTech (1992)
• Habilitation à Diriger des Recherches (Université de Versailles Saint Quentin en Yvelines)

Domaines de recherche :

• Variabilités individuelles de la réponse immunitaire chez le porc: étude du déterminisme génétique et du rôle des interactions entre l'hôte et son microbiote intestinal.
• Biologie comparative du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH)
• Génomique structurale et fonctionnelle

Expertise et coordination

• 2004-2015   Membre du Conseil d’Administration du Groupement d’Intérêt Economique Labogena
• 2013-2021   Membre de la commission administrative paritaire nationale des ingénieurs d’Etudes d’INRAE
• 2014-2016   Chair du comité Genetics of immune response and disease resistance de l'ISAG (International Society for Animal Genetics)
• 2014-2020   Membre élue au conseil scientifique de l’INRA (secteur génétique et santé animale)
• 2015-2019   Membre élue au conseil académique de l’Université Paris-Saclay et membre de son bureau
• 2015-2020   Coordination de Sciences Animales Paris-Saclay (SAPS)
• 2015-2020   Membre du conseil scientifique de l’Ecole Doctorale Structure et Dynamique des Systèmes Vivants
• 2016-2020   Responsable adjointe du département Sciences de la Vie de l’Université Paris-Saclay
• 2017-2022   Membre du conseil scientifique du DIM 1HEALTH
• 2017-2021   Chair du comité sur les microbiomes animaux de l’ISAG
• 2004-          Membre du groupe filière INRAE de production cunicole
• 2014-          Membre du Conseil scientifique de l’Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort
• 2019-          Chair du Veterinary and Immunology Commitee (VIC) de l'International Union of Immunological Societies (IUIS)
• 2020-          Membre du comité de pilotage du métaprogramme HOLOFLUX d’INRAE
• 2020-          Directrice adjointe recherche de la graduate school Biosphera de l’Université Paris-Saclay
• 2020-          Membre du comité exécutif du réseau international Phytobiome Alliance
• Membre du comité de nomenclature du complexe majeur d’histocompatibilité du porc (SLA Nomenclature Committee of the IUIS-VIC and of the ISAG)

Distinctions

• Médaille de Vermeil de l’Académie d’Agriculture de France (2014)
• Chevalier de l’Ordre National du Mérite
• Chevalier du Mérite Agricole
• Correspondante de l’Académie d’Agriculture de France, section 3 Production animale

Publications 2015-2022 :

Articles

Borey M, Blanc F, Lemonnier G, Leplat JJ, Jardet D, Rossignol MN, Ravon L, Billon Y, Bernard M, Estellé J, Rogel-Gaillard C. 2021. Links between fecal microbiota and the response to vaccination against influenza A virus in pigs. NPJ Vaccines, 6(1):92

Rogel-Gaillard C. 2021. Evolutions de la recherche en génétique animale et anticipation des besoins de formation. Ethnozootechnie 109: 11-22

Blanc F, Maroilley T, Revilla M, Lemonnier G, Leplat JJ, Billon Y, Ravon L, Bouchez O, Bidanel JP , Bed’Hom B, Pinard‑van der Laan MH, Estellé J, Rogel‑Gaillard C. 2021. Infuence of genetics and the pre-vaccination blood transcriptome on the variability of antibody levels after vaccination against Mycoplasma hyopneumoniae in pigs. Genet Sel Evol, 53:24

Munyaka PM, Blanc F, Estellé J, Lemonnier G, Leplat JJ, Rossignol MN, Jardet D, Plastow G, Billon Y, Willing BP, Rogel-Gaillard C. 2020. Discovery of predictors of Mycoplasma hyopneumoniae vaccine response efficiency in pigs: 16S rRNA gene fecal microbiota analysis. Microorganisms, 8(8):1151

Moroldo M, Munyaka PM, Lecardonnel J, Lemonnier G, Venturi E, Chevaleyre C, Oswald IP, Estellé J, Rogel-Gaillard C. 2020. Integrative analysis of blood and gut microbiota data suggests a non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD)-related disorder in French SLA(dd) minipigs. Sci Rep, 10(1):234

Hammer SE, Ho CS, Ando A, Rogel-Gaillard C, Charles M, Tector M, Tector AJ, Lunney JK. 2020. Importance of the Major Histocompatibility Complex (Swine Leukocyte Antigen) in swine health and biomedical research. Annu Rev Anim Biosci, 171-198

Massacci FR, Tofani S, Forte C, Bertocchi M, Lovito C, Orsini S, Tentellini M, Marchi L, Lemonnier G, Luise D, Blanc F, Castinel A, Bevilacqua C, Rogel-Gaillard C, Pezzotti G, Estellé J, Trevisi P, Magistrali CF. 2020.  Host genotype and amoxicillin administration affect the incidence of diarrhoea and faecal microbiota of weaned piglets during a natural multiresistant ETEC infection. J Anim Breed Genet, 137(1):60-72.

Revilla M, Friggens NC, Broudiscou LP, Lemonnier G, Blanc F, Ravon L, Mercat MJ, Billon Y, Rogel-Gaillard C, Le Floch N, Estellé J, Muñoz-Tamayo R. 2019. Towards the quantitative characterisation of piglets' robustness to weaning: a modelling approach. Animal, 13(11):2536-2546

Munyaka PM, Kommadath A, Fouhse J, Wilkinson J, Diether N, Stothard P, Estellé J, Rogel-Gaillard C, Plastow G, Willing BP. 2019. Characterization of whole blood transcriptome and early-life fecal microbiota in high and low responder pigs before, and after vaccination for Mycoplasma hyopneumoniae. Vaccine, 37(13):1743-175

Maroilley T, Berri M, Lemonnier G, Esquerré D, Chevaleyre C, Mélo S, Meurens F, Coville JL, Leplat JJ, Rau A, Bed'hom B, Vincent-Naulleau S, Mercat MJ, Billon Y, Lepage P, Rogel-Gaillard C, Estellé J. 2018. Immunome differences between porcine ileal and jejunal Peyer's patches revealed by global transcriptome sequencing of gut-associated lymphoid tissues. Sci Rep, 8:9077

Lee C, Moroldo M, Perdomo-Sabogal A, Mach N, Marthey S, Lecardonnel J, Wahlberg P, Chong AY, Estellé J, Ho SYW, Rogel-Gaillard C, Gongora J. 2018. Inferring the evolution of the major histocompatibility complex of wild pigs and peccaries using hybridisation DNA capture-based sequencing. Immunogenetics, 70:401-417

Maroilley T, Lemonnier G, Lecardonnel J, Esquerré D, Ramayo-Caldas Y, Mercat MJ, Rogel-Gaillard C, Estellé J. 2017 Deciphering the genetic regulation of peripheral blood transcriptome in pigs through expression genome-wide association study and allele-specific expression analysis. BMC Genomics, 18:967

Xiao L, Estellé J, Kiilerich P, Ramayo-Caldas Y, Xia Z, Feng Q, Liang S, Pedersen AØ, Kjeldsen NJ, Liu C, Maguin E, Doré J, Pons N, Le Chatelier E, Prifti E, Li J, Jia H, Liu X, Xu X, Ehrlich SD, Madsen L, Kristiansen K, Rogel-Gaillard C, Wang J. 2016. A reference gene catalogue of the pig gut microbiome. Nature Microbiology, 1:16161

Ramayo-Caldas Y, Mach N, Lepage P, Levenez F, Denis C, Lemonnier G, Leplat JJ, Billon Y, Berri M, Doré J, Rogel-Gaillard C, Estellé J. 2016. A phylogenetic network inference analysis applied to porcine gut microbiota composition identifies a consistent ecosystem structure linked with host growth traits. ISME J, 10:2973-2977

Gourbeyre P, Berri M, Lippi Y, Meurens F, Vincent-Naulleau S, Laffitte J, Rogel-Gaillard C, Pinton P, Oswald IP. 2015. Pattern recognition receptors in the gut: analysis of their expression along the intestinal tract and the crypt/villus axis. Physiol Rep, 3(2): e12225

Jacquier V, Estellé J, Schmaltz-Panneau B, Lecardonnel J, Moroldo M, Lemonnier G, Turner-Maier J, Duranthon V, Oswald IP, Gidenne T, Rogel-Gaillard C. 2015. Genome-wide immunity studies in the rabbit: transcriptome variations in peripheral blood mononuclear cells after in vitro stimulation by LPS or PMA-Ionomycin. BMC Genomics, 16:26

Gourbeyre P, Berri M, Lippi Y, Meurens F, Vincent-Naulleau S, Laffitte J, Rogel-Gaillard C, Pinton P, Oswald IP. 2015. Pattern recognition receptors in the gut: analysis of their expression along the intestinal tract and the crypt/villus axis. Physiol Rep, 3(2): e12225

Mach N, Berri M, Estellé J, Levenez F, Lemonnier G, Denis C, Leplat JJ, Chevaleyre C, Billon Y, Doré J, Rogel-Gaillard C, Lepage P. 2015. Early-life establishment of the swine gut microbiome and impact on host phenotypes. Environ Microbiol Rep. 7(3):554-69

Ouvrages et chapitres de livres

Borey M, Estellé J., Rogel-Gaillard C. 2022. Understanding the development of the gut microbiome in pigs: an overview. In Understanding gut microbiomes as targets for improving pig gut health. Eds M Bailey and C. Strokes, Burleigh Dodds series in agricultural sciences

Mage RG, Rogel-Gaillard C. Immunogenetics in the rabbit. 2021. In The Genetics and Genomics of the Rabbit, directeur de publication Luca Fontanesi (Italie), CABI publisher, pp 66-83

Génétique des animaux d’élevage – diversité et adaptation dans un monde changeant, Etienne Verrier, Denis Milan, Claire Rogel-Gaillard, coord. Collection Savoir faire, Editions Quae, 2020, 288 pages, ISBN 978-2-7592-3099-0, référence 02718

Bosi, S. (Directeur), Rogel-Gaillard, C. (Directeur) (2018). Biologie prédictive pour la santé : regards croisés sur les enjeux socio-économiques et scientifiques chez l'Homme, les animaux et les plantes. Séminaire MSH Paris-Saclay PREDICT, Cachan, FRA (2017-05-31). Cachan, France : MSH PARIS SACLAY EDITIONS. 109 p.