Des travaux en modélisation des plans de sélection animale sont nécessaires pour proposer de nouvelles modalités de gestion et d’amélioration génétique des populations, en adéquation avec la nécessaire transition écologique des systèmes de production. La conception et le pilotage de systèmes d’élevage agro-écologiques impliquent de reconnaître et de valoriser la diversité biologique et les interactions biotiques à tous les niveaux d'organisation pour améliorer l’adaptation des cheptels à des milieux peu standardisés. A cette fin, il s’agit de favoriser génétiquement la diversité des profils biologiques (objectif de complémentarité) et les interactions positives (objectif de coopération) entre animaux pour assurer la résilience des performances des cheptels face à des environnements fluctuants et changeants.

Un verrou scientifique important au développement de plans de sélection favorisant diversité et coopération entre individus porte sur le développement d’approches permettant la prise en compte des interactions multiples sur la résilience des performances des cheptels, en particulier quand les animaux sont élevés en grands groupes comme chez les espèces piscicoles ou avicoles. Les priorités portent, d’une part, sur les modalités de valorisation de la diversité génétique intra-cheptel et, d’autre part, sur la définition de stratégie de sélection à l’échelle de groupes de grande taille favorisant la coopération entre individus. Des programmes de simulation stochastique de populations en sélection, faisant intervenir dans des modèles individu-centrés les interactions entre individus, devront être développés pour répondre à ces attentes.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

- Elaborer des modèles conceptuels de schémas de sélection animale (modèles truite / poule) susceptible de valoriser la complémentarité et les interactions positives entre individus, établir les stratégies d’évaluation et sélection associées
- Développer les modèles mathématiques et les programmes de simulation correspondants
- Tester divers scénarios et analyser les résultats pour proposer des pistes concrètes de programmes de sélection permettant d’améliorer les performances et la résilience des cheptels d’animaux élevés en grands groupes
- Valoriser scientifiquement ainsi qu’auprès des acteurs de la sélection les approches proposées

Contact : 

• Florence Phocas, UMR1313 GABI (e-mail)