La microscopie électronique à transmission (MET) est une technique permettant d’observer des organites intracellulaires sur les échantillons coupés, de localiser des molécules avec des marqueurs. Elle est utilisée également pour visualiser des structures moléculaires (protéines ou acides nucléiques) et des microorganismes entiers par les techniques de colorations négatives. Un microscope électronique à transmission utilise un faisceau d'électron pour illuminer l'échantillon, et les électrons traversant l'échantillon, donc transmis, sont détectés sur un écran. 
La microscopie électronique permet de descendre à l’échelle des organites cellulaires mais il n'est alors plus question de matériel vivant. Son principe ressemble à celui de la microscopie photonique, la différence reposant sur l’origine de la source d'illumination qui n’est plus le photon mais l’électron. L’utilisation de ces électrons par rapport aux photons permet d’améliorer la résolution⁽¹⁾, c'est à dire le pouvoir séparateur du microscope. Cette amélioration est due à l’utilisation de particules accélérées (électrons) de longueur d’onde associée plus courte que celle des photons ce qui permet d’augmenter le grandissement. Le pouvoir de résolution de l’électron est plus de 600 fois supérieur au photon. Comme image on peut dire que dans un paysage, la microscopie photonique permet de voir la forêt, et la microscopie électronique les arbres et mieux leurs feuilles et les détails des feuilles.

Un petit historique : en 1929, le russe Ruska met au point le 1^er microscope électronique à transmission avec une résolution de 50 nm (actuellement pour un MET classique à 80 KV on admet une résolution de 0.3nm). En 1940, naissance du 1^ermicroscope électronique à balayage et plus récemment en 1980 mise au point du microscope à champ proche.

Liste des équipements disponibles:

- Hitachi HT 7700 120kV option Haut Contraste et Tomographie

- Ultramicrotome/cryo-ultramicrotome (FC6/UC6 – Leica)

- Ultramicrotome (Reichert E - Leica)

- Automate de cryo-substitution (AFS1 – Leica)

L’automate de cryo-substitution Leica AFS permet l’inclusion à basse température d’échantillon soit cryo-fixés soit fixés chimiquement  dans une résine de type LR white ou Lowicryl. L’automate permet ensuite la polymérisation de la résine sous UV à basse température.

- Appareil inclusion à micro-onde (KOS – Milestone)

L'automate offre 2 fonctions:- démasquage antigènique : L'étape de démasquage améliore l'accessibilité des antigènes grâce aux micro-ondes, pour des  immunomarquages  sur coupes histologiques- inclusions :  les étapes de préparation du matériel biologique sont accélérées grâce aux micro-ondes (fixation, contraste, déshydratation et substitution dans la résine)

Offres proposées:

-          Prestations : prise en charge des échantillons de la fixation à l’image

-          Formations : préparation et/ou coupes et/ou utilisation du MET

-          Collaboration : développement technologique