En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal PROSE Université Paris Saclay Carnot 3BCAR

Unité de recherche PRocédés biOtechnologiques au Service de l\'Environnement (PROSE)

Ingénieur-e en ingénierie logicielle

CDD 19 mois - Mars 2022

21 janvier 2022

Ingénieur-e en ingénierie logicielle
© V. Marracci
CDD 19 mois - Mars 2022

VOTRE MISSION ET VOS ACTIVITÉS

Vous serez accueilli(e) au sein de l’Unité de Recherche PROSE (PRocédés biOtechnologiques au Service de l’Environnement) située à Antony (92) (https://www6.jouy.inrae.fr/prose/). PROSE est une unité de recherche INRAE intégrée à l’Université Paris-Saclay. Composée d’une trentaine de personnes (21 permanents), PROSE est une unité multidisciplinaire qui mène des recherches sur les biotechnologies environnementales (stations de traitement et de valorisation des eaux usées, digesteurs anaérobies, procédés bioélectrochimiques pour la bioraffinerie environnementale…), depuis l’échelle des communautés microbiennes jusqu’à celle des procédés, en articulation avec les grands enjeux sociétaux de développement durable, d’économie circulaire et de bioéconomie.

PROSE développe DeepOmics depuis plus de 4 ans. Il s’agit d’un système d’information (SI), intégrant un entrepôt de données méta-omiques (ex : séquençage haut-débit). Ces données sont issues de procédés de biotechnologies environnementales (réacteurs de laboratoires et installations industrielles). DeepOmics vise d’une part à encourager les bonnes pratiques en matière de gestion et partage des données (FAIR data). D’autre part, son objectif est de permettre de croiser les données métier (paramètres de conception des procédés, paramètres opératoires et mesures physico-chimiques) et les données méta-omiques. Il permettra la fouille de données, facilitant par exemple la mise en œuvre de méta-analyses biostatistiques pour l’élaboration de biomarqueurs de monitoring, et favorisant ainsi les retombées applicatives et l’innovation.
En phase de pré-production, DeepOmics contient déjà des données issues de plusieurs séries d’expériences récentes menées dans le cadre de projets de recherche. Pour passer en production, il reste à développer quelques fonctionnalités clés, en particulier un module convivial d’interrogation de ces données.

De façon générale, vous aurez pour mission de réaliser ce moteur de recherche et de participer aux différentes évolutions fonctionnelles de DeepOmics, telles que l’interopérabilité avec des logiciels ou SI complémentaires.
Votre encadrement fonctionnel sera assuré par l’unité PROSE. Vous y interagirez plus particulièrement avec la chercheuse qui coordonne le projet. Un ingénieur en bioinformatique et une ingénieure en biostatistiques, qui possède également de solides compétences en informatique, sont également membres de PROSE.
Votre encadrement technique sera assuré par la DSI d’INRAE, localisée à Lyon, qui assure cette responsabilité depuis le début du développement de DeepOmics.

Enfin, vous aurez également des interactions avec l’unité INRAE Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement (LBE), située à Narbonne (https://www6.montpellier.inrae.fr/narbonne), afin d’assurer l’interopérabilité entre des logiciels et une ontologie de bioraffinerie environnementale développés au LBE, et DeepOmics.

Vous serez plus particulièrement en charge de

  • contribuer à l'activité de gestion de projet (estimer, planifier, suivre),
  • réaliser tout ou partie du développement logiciel,
  • modéliser, concevoir et/ou paramétrer tout ou partie de la solution logicielle,
  • assembler les composants logiciels, intégrer et paramétrer les progiciels utilisés,
  • participer à la rédaction de la documentation (développeur et exploitation),
  • élaborer les jeux d’essais, d’intégration et de résistance à la charge,
  • rédiger le cahier de recettes de l’application,
  • participer au déploiement de l’application (installation, assistance, formation), à la maintenance corrective et évolutive,
  • travailler en équipe de projet et participer à l’animation de l’équipe de réalisation.

Actuellement, les développements sont principalement réalisés en PHP dans le framework Symfony (système de gestion de bases de données relationnelles PostgreSQL) ainsi qu’AngularJS côté client, et parfois en R et Shiny. La gestion du projet et du code sont essentiellement menées sous Gitlab. Docker est utilisé pour émuler un serveur de production sur le poste du développeur, qui requiert un système d’exploitation Linux. Pour assurer la qualité du code, des outils de vérification de code sont utilisés en intégration continue sur la forge, en complément de l’utilisation d’un IDE avancé (PhpStorm).

Conditions particulières d’activité

Plusieurs déplacements à Lyon et Narbonne sont prévus dans le cadre de vos missions. Chaque déplacement aura une durée totale de l’ordre de quelques jours à une semaine. Un total d’environ 3 à 6 déplacements sont à prévoir sur la durée du contrat.

LE PROFIL QUE NOUS RECHERCHONS

  • Formation recommandée : bac + 5 minimum obtenu dans une filière informatique.
  • Connaissances souhaitées :
    • Vous avez des connaissances approfondies de langages de programmation, ainsi que des connaissances des techniques de développement d’applications client léger (web) et des bases de données. Vous connaissez également une méthode d’analyse de besoin, de spécification et de conception. Vous possédez de solides connaissances sur les systèmes d’information (développement full stack avec API REST).
    • Des notions scientifiques de base (biologie, physico-chimie) ou des notions sur le séquençage haut-débit et les bases de données biologiques seront appréciées.
  • Expérience appréciée : une expérience de 2 à 3 ans comme développeur informatique est un plus.
  • Aptitudes recherchées :
    • Des compétences en langage PHP, JavaScript, ou R et la connaissance d’un framework de développement de type Symfony, AngularJS, seront très appréciées.
    • Anglais: niveau courant d'anglais lu (lecture technique).

VOTRE QUALITE DE VIE À INRAE

En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat :

Modalités d'accueil
Modalités pour postuler
  • Unité: PROSE
  • Code postal + ville : 92160 Antony
  • Type de contrat : CDD
  • Durée du contrat : 19 mois
  • Date d’entrée en fonction : 01/03/22 (ajustable)
  • Rémunération : ˜2 030€ à 2 150€ bruts mensuels, selon le niveau d’expérience
  • Transmettre une lettre de motivation et un CV à : Ariane Bize
  • Par e-mail : ariane.bize@inrae.fr
  • Date limite pour postuler : 30/03/2022
Site : Plus d'informations sur INRAE jobs