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Le poumon a longtemps été considéré comme un organe stérile dépourvu d’une flore microbienne. L’avancée des technologies a permis de mettre en évidence que la muqueuse pulmonaire est aussi soumise à une colonisation progressive par un microbiote dès naissance. Ce processus de colonisation du poumon par un microbiote pose la question de son influence sur la maturation de la barrière épithéliale pulmonaire et sur le développement de l’immunité. Dans une étude parue dans FASEB J, l’équipe V2I en collaboration avec l’équipe ProbiHôte de l’institut MICALIS (INRAE/UPSaclay, Jouy-en-Josas) montrent que la présence d’un microbiote module la réactivité du tissu pulmonaire à différents ligands mimant ou issus de pathogènes (appelés PAMPs). Ainsi des stimulations ex vivo par différents PAMPs d’explants pulmonaires (coupes de poumons obtenus en utilisant un microtome, « Krumdieck Tissu Slicer ») de souris axéniques (animaux dépourvus de flores microbiennes) entrainent des productions de cytokines plus rapides et plus fortes que celles engendrées par des coupes issues de poumons de souris conventionnelles (animaux pourvus de flores microbiennes). De plus, des souris axéniques instillées par voie nasale avec du LPS, un composant de la paroi des bactéries Gram^-, présentent une réaction inflammatoire du tissu pulmonaire et un recrutement des neutrophiles plus rapides que ceux observés chez les souris conventionnelles. Ainsi, ces résultats démontrent que le microbiote est un élément participant à la modération de la réponse immune de la muqueuse pulmonaire et par conséquent, la sensibilité des poumons à des pathogènes.