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Les maladies infectieuses sont un frein au développement raisonné d’une aquaculture « durable ». Flavobacterium psychrophilum est responsable de la flavobactériose, une maladie dont les épisodes infectieux récurrents sont associés à de fortes mortalités et à l’utilisation d’antibiotiques, avec un impact économique et écologique important dans les piscicultures de salmonidés à l’échelle mondiale. En l’absence de vaccins efficaces, la compréhension du processus infectieux et des bases moléculaires de la résistance à la maladie est une étape clé pour le développement de stratégies préventives efficaces.

Dans une étude publiée dans Microbes & Infection, des chercheurs de l’équipe Infection et Immunité des Poissons (unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM, INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec les unités GABI et IERP de l’INRAE, ont établi un ensemble de phénotypes liés à la pathogenèse grâce à la caractérisation d’une collection de lignées isogéniques de truite à la résistance contrastée. Dans une démarche guidée par le principe des 3R, un suivi individuel par prélèvement sanguin non létal a été appliqué pour la première fois chez la truite pour suivre une infection bactérienne ainsi que la réponse de l’hôte ; cette approche permet à la fois de réduire le nombre de poissons utilisés et d’augmenter la puissance du dispositif expérimental.

L’étude a montré que la résistance est associée à un meilleur contrôle de la croissance bactérienne par le poisson ; dans le sang des animaux résistants, certains gènes de l’immunité impliqués dans le métabolisme de l’arginine et dans la détection et la destruction des bactéries pathogènes sont surexprimés.

Cette étude a été rendue possible grâce à des financements de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR-17-CE20-0020-0) et de l’union européenne (Horizon 2020 # 817923, AQUAFAANG).