En savoir plus

Léa Meyer (équipe Influenza) a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse intitulée : "Rôle de la protéine accessoire virale PA-X dans la pathologie des virus Influenza faiblement pathogènes".

La soutenance aura lieu le lundi 20 Novembre 2017 à 14h00 dans l’amphithéâtre du bâtiment 440 à l’INRA de Jouy-en-Josas.

Résumé :

L’objectif de ce travail de thèse a été de caractériser les mécanismes d’action de virus influenza A faiblement pathogènes chez le poulet. Ce travail s’articule autour de deux axes : la caractérisation de la réponse à l’infection d’une lignée épithéliale pulmonaire de poulet (CLEC213) par des virus aviaires faiblement pathogènes et le rôle de la protéine accessoire virale PA-X au cours de l’infection. Dans un premier temps, nous avons mis en évidence par transcriptomique que l’infection virale par deux souches aviaires faiblement pathogènes, en plus d’induire des voies de signalisation cellulaire et de l’immunité innée caractéristiques des virus influenza, induit une signature mitochondriale forte. Les produits de ces gènes sont des protéines impliquées dans la phosphorylation oxydative, la voie métabolique centrale de la respiration cellulaire. Nous avons montré que cette signature transcriptomique s’accompagne d’un effet fonctionnel. La production d’ATP, le produit de la phosphorylation oxydative, est augmentée en présence du virus dès les premières heures de l’infection. Nous avons dosé le virus en présence de drogue bloquant la phosphorylation oxydative en conditions viables pour la cellule et montré que la réplication efficace du virus s’appuie sur une respiration cellulaire fonctionnelle. Dans un second temps, nous avons choisi d’étudier l’effet de la protéine virale nouvellement décrite PA-X sur l’infection des CLEC213. Nous avons généré un virus recombinant incapable de synthétiser PA-X et comparé l’infection des CLEC213 par les virus sauvage et mutant à l’aide de l’outil transcriptomique. Cette analyse met en évidence un effet important de PA-X sur les voies métaboliques de la cellule tel que la glycolyse, la gluconéogenèse, la dégradation du pyruvate en lactate, ainsi que des gènes associés au fonctionnement de la mitochondrie. Ainsi, PA-X pourrait être impliquée dans la reprogrammation métabolique des cellules infectées.

Abstract:

This work aimed at characterizing the mechanisms ruling low-pathogenic influenza virus infections in chickens. This work is built around two axes: characterization of the response of a chicken lung epithelial cell line (CLEC213) to a low-pathogenic influenza infection and the role of viral accessory protein PA-X in infection. We first showed that viral infection not only induced a classical panel of immune response but also a strong metabolic signature. This signature showed an effect of infection on oxidative phosphorylation, a central metabolic pathway. This signature was observed at a functional level: ATP production, oxidative phosphorylation’s final metabolite, was enhanced upon infection. We quantified the virus in the presence of an oxidative phosphorylation inhibitor, oligomycin, and showed the virus relies on this enhanced ATP production to support efficient viral replication. In a second part, we investigated the role of accessory viral protein PA-X on CLEC213 cells infection. We generated a recombinant virus unable to express PA-X and compared its transcriptomic signature to that of the WT virus. This analysis showed an effect of PA-X on central metabolic pathways such as glycolysis, pyruvate to lactate conversion as well as mitochondrial genes, thus meaning that PA-X could be involved in metabolic reprogramming of the infected cells.